SCG1000单细胞高效液滴生成仪
谱今生物与森西赛智联合研发的SCG1000单细胞液滴生成仪能为细胞或细胞核的高效分离和标记提供稳定的动力。
该仪器配备8个独立控制的微流控芯片,支持1-8个样本灵活上样;
2.5 min 内快速生成油包水液滴,最大限度保障细胞活性;
单张芯片可捕获18,000个细胞,细胞捕获率高达60%;
兼容单细胞3’、5’、ATAC文库制备需求。
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产品介绍
谱今生物与森西赛智联合研发的SCG1000单细胞液滴生成仪能为细胞或细胞核的高效分离和标记提供稳定的动力。
SCG1000单细胞数字液滴系统 (Digital Droplet System)可以自动化、一键式完成单细胞分离、捕获及标记,搭配谱今生物自主研发的高通量单细胞试剂盒进行使用,同时配备单细胞数据分析软件SCG Tools 进行数据分析。
产品原理
SCG1000单细胞单细胞液滴生成仪是基于微流控技术,将带有条形码和引物的编码微球和单个细胞包裹为独立的微反应体系。编码微球尾部设计了Cell Barcode(标记细胞)、UMI(标记mRNA)和OligodT(与mRNA的polyA特异性互补配对),完成细胞及mRNA的分离标记,通过逆转录及高通量测序文库的测序,获取mRNA的3端序列,即可一次性获得大量单细胞的基因表达数据,从而实现在单细胞水平进行转录组测序的目的。其能够以高通量和单分子分辨率研究单个细胞表达谱,揭示复杂细胞群体的异质性,避免单个细胞的基因表达信号被群体的平均化所掩盖,在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学等领域发挥重要作用正成为生命科学研究的焦点。
实验流程
① 单细胞分离标记
将制备好的单细胞悬液通过SCG1000液滴生成仪的“?”字形通道形成为微反应体系。
② 单细胞文库构建
在液滴内进行反转录;然后通过cDNA扩增、连接测序接头等进行高通量测序文库的制备。
③ 高通量测序
在高通量测序平台进行测序,可兼容Illumina和华大测序平台。
④单细胞数据分析
通过单细胞数据分析软件SCG Tools自动完成细胞标签的提取、数据质控、基因定量以及聚类分析等,并生成可视化的分析报告。
产品特点
样本通量:8个单独控制的微流控芯片,单次运行1-8个样本;
细胞通量:单次可获得500-18,000个细胞;
单细胞捕获效率:2.5min中内生成15-20万微液滴,细胞捕获率60%;
双细胞率:1000个细胞,双效率约0.3%;
细胞范围:可捕获细胞直径为5~50 μm的真核细胞(贴壁细胞、悬浮细胞、组织、血液等);
配备软件分析系统:配备的单细胞数据分析软件SCG Tools自动完成细胞标签的提取、数据质控、基因定量以及聚类分析等,并生成可视化的分析报告;
适用文库类型:兼容单细胞3’、5’、ATAC文库制备需求。
仪器搬运方便:体积小,重量轻( 3.6 kg),方便搬运,便于随时随地进行单细胞实验。
产品优势
应用展示
一、医学领域
肿瘤研究:
①肿瘤异质性分析:精确识别肿瘤组织中不同类型的癌细胞及其亚群,研究肿瘤的发生、发展机制以及对治疗的反应差异机制(包括耐药机制等)。
②肿瘤微环境研究:分析肿瘤微环境中的免疫细胞、基质细胞等其他非癌细胞的组成和功能状态,研究免疫细胞与癌细胞的相互作用。
③治疗监测和预后判断:通过追踪治疗过程中肿瘤细胞的基因表达变化,监测治疗效果,预测患者的预后情况,及时调整治疗策略。
免疫系统疾病研究:分析免疫细胞的异质性,研究免疫系统疾病的发病机制,为疾病的诊断和治疗提供新的靶点和思路。
感染性疾病研究:研究感染机制,分析感染过程中宿主细胞和病原体的相互作用,了解病原体的感染途径、宿主细胞的免疫反应等。
生殖健康
①胚胎植入前遗传学诊断:在辅助生殖技术中,对胚胎的单个细胞进行测序,检测染色体异常、基因突变等遗传缺陷,选择健康的胚胎进行移植,提高试管婴儿的成功率,降低出生缺陷的风险。
②生殖细胞发育研究:研究精子、卵子等生殖细胞的形成过程和发育机制。
二、生物学基础研究领域
发育生物学:研究胚胎发育过程中不同细胞的分化、增殖和迁移等过程,揭示细胞命运决定的分子机制。
神经科学:分析神经系统中不同类型神经元细胞的基因表达和功能差异,研究神经元的发育、连接和信号传递机制,对于理解大脑的结构和功能以及神经系统疾病的发病机制具有重要意义。
三、药物研发领域
药物靶点发现:通过对疾病相关细胞的单细胞分析,发现新的药物靶点,为药物研发提供新的方向。
药物筛选和评估:利用单细胞技术评估药物对不同细胞的作用效果,筛选出具有治疗潜力的药物。可以分析药物处理后细胞的基因表达、代谢变化等,预测药物的疗效和毒性。